Las noticias más antiguas referentes a Enkarterri provienen del siglo XII y la primera mención a las reuniones en Abellaneda se datan en 1394. Fue a partir de 1500 cuando cada concejo comenzó a enviar un representante a las Juntas, época en la que también se construyó la primera Casa de Juntas, sustituida en 1592 por la actual.

La Casa de Juntas fue durante siglos emblema de las libertades políticas y la singularidad del territorio. Reconvertida hoy en Museo de Las Encartaciones, es un espacio para la investigación y la difusión de la historia, el patrimonio y la etnografía de la comarca.